Sarcinile principale ale Centrului:

• organizarea, dezvoltarea şi dirijarea metodică a sistemului de stat al observaţiilor meteorologice şi agrometeorologice;

• elaborarea prognozelor de interes public şi a avertismentelor privind fenomenele meteorologice nefavorabile, care se transmit regulat organelor administraţiei publice centrale şi locale, serviciilor mass-media;

• asigurarea agenţilor economici cu informaţie specializată în baza contractelor încheiate conform planurilor-schemă coordonate de Ministerul Mediului;

• controlul utilizării informaţiei meteorologice de către agenţii economici;

• prezentarea la cerinţa persoanelor juridice şi fizice a informaţiei specializate, care confirmă fenomenele periculoase şi stihinice, amploarea şi intensitatea lor;

• analiza sistematică, generalizarea condiţiilor meteorologice şi agrometeorologice create, perfectarea şi publicarea materialelor informative şi de regim şi asigurarea organelor administraţiei publice centrale şi locale, agenţilor economici şi a populaţiei cu informaţie metodică şi de regim;

• efectuarea cercetărilor ştiinţifice şi aplicative în domeniul meteorologiei.

       În structura Centrului sunt incluse următoarele Direcţii:

• Direcţia Prognoze Meteorologice (DPM);

• Direcţia Meteorologie și Climatologie (DMC);

• Direcţia Monitoring Agrometeorologic (DMA);

• Reţeaua Naţională de Observaţii Meteorologice (RNOM).